鉴定费用由申请人预先缴纳，然后根据鉴定结果、用人单位工伤投保情况、鉴定的次数不同，分别由不同的主体实际承担。
具体是：
一.初次鉴定的费用
1.初次劳动能力鉴定的费用，用人单位为工伤职工购买了工伤保险的，则由工伤保险基金支付；
2.用人单位没有为工伤职工购买工伤保险的，则由用人单位承担。
3.工伤职工或其直系亲属无需为初次鉴定负担费用。
二.再次鉴定的费用
1.无论是用人单位，还是工伤职工或其直系亲属，对初次劳动能力鉴定的结果有异议的，可以向省级劳动能力鉴定委员会提起再次鉴定申请，鉴定费用由申请人预先缴纳。
2.如果再次鉴定的结论与初次鉴定的结论一致，则鉴定费用由申请人承担，包括工伤职工或其直系亲属为申请人的情形；
3.如果再次鉴定的结论与初次鉴定的结论不一致，则鉴定费用由工伤保险基金承担，用人单位没有为工伤职工购买工伤保险的，则由用人单位承担。
三.复查鉴定的费用
1.劳动能力鉴定后工伤职工的伤情发生变化，用人单位、工伤职工或其直系亲属、工伤保险经办机构申请复查鉴定的，申请人同样需要预先缴纳鉴定费用。
2.如果复查鉴定的结论与初次鉴定的结论一致，则复查鉴定费用由申请人负担；
3.如果复查鉴定的结论与初次鉴定的结论不一致，则鉴定费用由工伤保险基金承担，用人单位没有为工伤职工购买工伤保险的，则由用人单位承担。
劳动能力鉴定费用内容
一般情况下，劳动能力鉴定费用包括直接用于鉴定的费用和其他与鉴定有关的必要费用两大部分。
直接用于鉴定的费用，主要用于下列各类事项：
(1)进行劳动能力鉴定聘请专家应当给付的报酬。劳动能力鉴定过程中，邀请专家参加鉴定的费用包含在鉴定费之中，劳动能力鉴定委员会不得就此另行向申请人收取费用；
(2)召开劳动能力鉴定会议的费用；
(3)制作劳动能力鉴定所需表、卡、册、证等费用；
(4)其他与劳动能力鉴定直接相关的费用。
这些费用的收取均具有非营利性的特点，是开展劳动能力鉴定的必要费用。
其他与劳动能力鉴定有关的必要费用包括：
(1)到指定医疗机构进行诊断的费用。
一般情况下，对被鉴定者进行检查所需费用已包含在鉴定费的范围之内，对被鉴定者进行仪器辅助检查时不得另行收取费用。
但由于条件限制，劳动能力鉴定委员会不能自行检查，必须委托具备资格的医疗机构协助进行有关的诊断，而指定被鉴定人到指定医疗机构进行检查时，发生的相关费用需要由申请人自行支付。
也就是说，在鉴定过程中，被鉴定人到指定医疗机构进行诊断的费用不包括在鉴定费之中，需要申请人按照医疗机构的收费标准另行向医疗机构支付。
(2)鉴定人的差旅费等相关费用。
劳动能力鉴定委员会的鉴定人员如需到某个场所调查相应材料和证据，或者出庭作证会发生相关差旅等费用，此笔费用不包含在第一部分的鉴定费中，发生时由申请人另行支付。
【法律依据】
《社会保险法》第三十八条
因工伤发生的下列费用，按照国家规定从工伤保险基金中支付：
（一）治疗工伤的医疗费用和康复费用；
（二）住院伙食补助费；
（三）到统筹地区以外就医的交通食宿费；
（四）安装配置伤残辅助器具所需费用；
（五）生活不能自理的，经劳动能力鉴定委员会确认的生活护理费；
（六）一次性伤残补助金和一至四级伤残职工按月领取的伤残津贴；
（七）终止或者解除劳动合同时，应当享受的一次性医疗补助金；
（八）因工死亡的，其遗属领取的丧葬补助金、供养亲属抚恤金和因工死亡补助金；
（九）劳动能力鉴定费。
