处理违反用工单位规章制度的派遣员工：

1、用工单位可以根据公司的规章制度进行处罚；

2、严重违法规章制度的，公司可以依据劳务派遣协议的约定将派遣员工退回劳务派遣公司；

3、派遣员工给用工单位造成损失的，用工单位可以像劳务派遣公司或者派遣员工本人追偿。

【法律依据】

《劳动合同法》第五十九条，劳务派遣单位派遣劳动者应当与接受以劳务派遣形式用工的单位(以下称用工单位)订立劳务派遣协议。劳务派遣协议应当约定派遣岗位和人员数量、派遣期限、劳动报酬和社会保险费的数额与支付方式以及违反协议的责任。