员工在申请休年假时，如果单位有合理的理由不批准，这并不构成违法行为。

根据《职工带薪年休假条例》的规定，单位在安排员工年休假时，会综合考虑生产、工作的实际情况以及员工的个人意愿。年休假可以在一个年度内集中安排，也可以分段安排，通常不会跨年度进行。然而，如果单位的生产、工作特性确实需要跨年度安排员工的年休假，那么可以允许跨一个年度进行。

这意味着，尽管带薪年休假是员工的法定权利，但单位在不影响正常生产秩序的前提下，有权根据具体情况来决定是否批准员工的年休假申请。例如，如果所有员工都同时申请休假，或者某个关键岗位的员工休假会导致工作无法正常运转，单位可能会选择不批准这些休假申请。

因此，员工在申请带薪年休假时，应当与单位进行充分的沟通和协商，确保休假安排不会影响到单位的正常运营。同时，员工也需要注意，带薪年休假并非随心所欲的休假，而是需要在与单位协商并合理安排工作后才能享受。

关于带薪年休假的具体安排和补偿：

员工在连续工作满一年后，享有保留职务和工资的带薪年休假。具体的休假天数根据员工的累计工作年限来确定，从5天到15天不等。请注意，国家法定休假日和休息日并不计入年休假的假期。

然而，如果员工存在某些特定情况（如享受寒暑假、请事假超过一定天数、请病假超过一定期限等），则可能无法享受当年的年休假。

对于因工作需要无法安排员工休年假的单位，应当与员工协商并经过员工同意后，可以选择不安排员工休年假。对于员工应休未休的年假天数，单位应当按照员工日工资收入的300%支付年休假工资报酬作为补偿。

【法律依据】

《劳动合同法》第四十五条，国家实行带薪年休假制度。

劳动者连续工作一年以上的，享受带薪年休假。具体办法由国务院规定。

《职工带薪年休假条例》第二条

机关、团体、企业、事业单位、民办非企业单位、有雇工的个体工商户等单位的职工连续工作1年以上的，享受带薪年休假（以下简称年休假）。单位应当保证职工享受年休假。职工在年休假期间享受与正常工作期间相同的工资收入。

第五条

单位根据生产、工作的具体情况，并考虑职工本人意愿，统筹安排职工年休假。

年休假在1个年度内可以集中安排，也可以分段安排，一般不跨年度安排。单位因生产、工作特点确有必要跨年度安排职工年休假的，可以跨1个年度安排。

单位确因工作需要不能安排职工休年假的，经职工本人同意，可以不安排职工休年假。对职工应休未休假天数，单位应当按照该职工日工资收入的300%支付年休假工资报酬。